草莓果实的营养价值丰富,富含膳食纤维和多种维生素[1]。目前我国已经成为世界上最大的草莓生产国,种植方式主要以设施大棚为主[2]。然而,长期单一种植草莓和不合理施用化肥,导致土壤理化性质恶化、微生物区系劣变、化感物质累积。例如,草莓连作下的土壤板结、酸化和盐渍化,抑制植物根系对养分的吸收;对植物有益的微生物放线菌数量减少,而有害的镰刀菌数量增加;阻碍植物生长的自毒化感物质(如脂类化合物棕榈酸、硬脂酸和油酸)大量积累[3-6]。土壤环境的恶化不仅抑制植株的正常生长,还降低果实的产量和品质,给草莓产业带来巨大的经济损失[7-8]。
绿肥在增加土壤肥力、改善土壤质量、提高资源利用率等方面有重要价值,其应用被视为建立可持续性发展农业的重要策略[9]。以豆科植物作为绿肥介导作物增产和提质效应是当前研究的热点。例如,夏闲期种植并翻压豆科绿肥(如绿豆)增加土壤有机质和有效养分的含量、降低后茬草莓枯萎病的发病率,进而促进草莓植株生长并提高果实产量[10]。草木樨绿肥提高多种土壤酶(如蔗糖酶、脲酶、磷酸酶)的活性,从而促进土壤中的养分循环和物质转化,对作物生长和产量形成正效应[11]。此外,紫云英绿肥通过动态调节稻田土壤中氨氧化细菌、古菌的丰度,降低土壤硝态氮淋失的风险,进而提高水稻产量[12]。然而,禾本科绿肥对草莓植株生长、果实产量和品质的影响及作用机制在很大程度上未知。
土壤代谢物是植物-微生物互作的重要介质,具有双重作用。一方面,一些糖类代谢物可以为微生物提供碳源,如果糖、山梨糖和甘露糖,且这几种糖类物质可以诱导有益微生物(如植物根际促生菌)的趋化作用和生物膜形成,从而在植物根际定殖,促进植物生长并维持健康[13-15]。另一方面,化感物质(如脂类代谢物)的积累会抑制植物的生长[5-6]。然而,研究表明多种微生物(如芽孢杆菌和根瘤菌)可以降解/利用化感物质[16]。目前少有研究报道绿肥介导下的代谢物-微生物协同变化模式,及该模式对植物的作用效应。
本研究通过长期定位田间试验,评估三种禾本科绿肥(玉米、高粱和高丹草)处理对后茬草莓植株生长和生理特性、果实产量和品质、土壤化学特征、微生物组和代谢组的影响,旨在揭示绿肥介导的草莓增产和提质机制,从而丰富设施大棚草莓种植技术和理论的科学基础。
1 材料与方法 1.1 试验地概况试验地位于陕西省西安市鄠邑区(34°6' N,108°31' E),海拔430 m,地势平坦。该地区属暖温带大陆性季风气候区,年均气温13.5℃,年均降水量627 mm,多集中于夏秋季节,雨热同季。供试土壤为
设置4个处理:CK,休闲农田-草莓(Fragaria × ananassa Duch.);MA,玉米(Zea mays L.)-草莓;SO,高粱[Sorghum bicolor(L.)Moench]-草莓;SS,高丹草(Sorghum × sudangrass)-草莓。采用完全随机区组试验设计,每个小区面积60 m2(4 m × 15 m),每个处理3次重复。
2017年6月起,在设施大棚内开展长期定位试验,一年一季。于每年6月初播种不同绿肥作物,高丹草和高粱籽粒播种量均为每小区0.24 kg,玉米籽粒播种量为每小区0.96 kg。绿肥种植期间不施肥。每年7月中旬收获并将绿肥切碎翻压于土壤中,翻压深度20 cm,每个小区翻压量均约60 kg(以干重计)。玉米、高粱和高丹草翻压时的鲜草氮含量分别为29、25和23 g·kg–1,磷含量分别为2.6、2.3和2.2 g·kg–1,钾含量分别为26、20和24 g·kg–1。翻压后的绿肥腐解至8月初,起垄,8月中旬移栽草莓。所有处理每季草莓施肥量一致,N、P2O5和K2O的施用量分别为135 kg·hm–2、80 kg·hm–2和150 kg·hm–2,以1:1的比例分基肥和追肥施用,追肥从草莓花期开始施用,每半月施用一次,平均分为12次施用完毕。
1.3 样品采集于2021年1月草莓盛果期采集果实,每处理随机选取6株,称重后4℃冷藏用于果实品质的测定。同时,测定叶片的叶绿素含量,再将整株草莓挖出,抖落根系土壤,用无菌刷收集草莓根际土壤,混匀,一部分风干、过筛并测定土壤化学特征参数,一部分液氮速冻后-80℃保存用于土壤代谢组的测定及细菌群落高通量测序。整株草莓用无菌水冲洗三次后沥干,测定根系形态、活力及植株生物量。
1.4 测定指标及方法采用便携式叶绿素仪(SPAD-502)测定草莓叶片叶绿素含量。用根系扫描仪(i800 plus)扫描草莓根系,使用WinRHIZO软件(Regent Instruments,Canada)测定根系形态(根表面积、根长、平均根直径和根尖数)。根系活力采用氯化苯基四氮唑法测定[17]。草莓植株70℃烘干至恒重,称量干重。
称重法测定草莓单株的果实产量。草莓果实的维生素C(VC)含量采用碘量法测定,可溶性总糖含量采用蒽酮比色法测定,总酸含量采用酸碱滴定法测定[18]。草莓果实的可溶性固形物含量采用手持数字测糖仪(TD-45)测定。
采用电位法测定土壤pH,一次平衡法测定土壤阳离子交换量(CEC),K2Cr2O7-外加热法测定土壤有机质(SOM)含量,碱解扩散法测定土壤碱解氮(AN)含量,钼锑抗比色法测定土壤有效磷(AP)含量,火焰光度法测定土壤速效钾(AK)含量[19]。用3,5-二硝基水杨酸比色法测定土壤蔗糖酶(SSC)活性,磷酸苯二钠比色法测定土壤磷酸酶(SACP)活性,苯酚钠-次氯酸钠比色法测定土壤脲酶(SUE)活性[20]。
取0.5 g土壤样品,用于细菌群落的高通量测序。用Fast DNA Spin Kit for Soil试剂盒(MP Biomedicals,USA)提取土壤总DNA,并通过微孔板分光光度计(Thermo Fisher Scientific,USA)测定所提取DNA的质量和浓度。细菌16S rRNA引物序列为338F:5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’和806R:5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’,PCR扩增16S rRNA基因的V3-V4高变区[21],再经回收定量,利用Illumina高通量测序平台Miseq PE300进行测序。去除测序得到的原始数据中可能存在的PCR扩增与测序错误,得到优化序列,按照97%相似性对非重复序列(不含单序列)进行聚类并去除嵌合体,将所有优化序列映射至操作分类单元(OTU)代表序列,得到OTU。用R 4.1.0软件(R Foundation for Statistical Computing,Austria),基于Bray-Curtis距离算法进行非度量多维尺度分析(NMDS),ANOSIM检验用于评估不同处理间的群落结构是否存在显著差异。用Mothur软件计算细菌群落的α-多样性指数(Shannon和Chao1)。根据线性判别分析效应大小(LEfSe)方法,基于Kruskal-Wallis和配对Wilcoxon检验,区分不同处理下的特定细菌类群,线性判别分析(LDA)得分(经log10转换) > 2被认为是数量显著增加的菌属。
另取0.5 g土壤样品,用于测定代谢组。土壤样品加入1 mL甲醇-异丙醇-水(3:3:2 V/V/V)提取液,室温震荡3 min后置于冰水浴下超声20 min,再于4℃下12 000 g·min–1离心3 min。上清液转移到样品瓶,加入0.02 mL内标(10 μg·mL–1),氮吹仪吹干,置于冻干机冷干。加入0.1 mL甲氧胺盐吡啶(0.015 g·mL–1),于37℃下肟化2 h,加入0.1 mL BSTFA(含1%TMCS),37℃反应30 min得到衍生化溶液。将衍生化溶液稀释至1 mL,0.22 μm有机相针式过滤器过滤,用于GC-MS检测。采用Agilent 8890气相色谱仪与5977B质谱仪耦合(Agilent Technologies,USA),对待测液进行GC-MS检测。使用DB-5MS色谱柱(30 m×0.25 mm×0.25 μm,J&W Scientific,USA);进样量1 μL;分流模式5:1;载气为氦气;柱流速为1.2 mL·min–1;柱箱程序升温,40℃下1 min,20℃·min–1升温至100℃,15℃·min–1升温至300℃并保持5 min;传输线、离子源和四级杆温度分别为280℃、230℃和150℃;电离电压70 eV;在扫描模式下分析所有样品。采用MWDB自建库(迈特维尔生物科技公司,武汉)质谱检索数据库,对代谢物进行定性定量分析。对样品进行的主成分分析(PCA)用R 4.1.0软件实现。根据显著性(P < 0.05)和单变量分析差异倍数(FC,FC ≥ 1.5或≤ 0.67)来筛选差异代谢物。使用MetaboAnalyst 5.0(https://www.metaboanalyst.ca/),基于Fisher精确检验,对差异代谢物进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。土壤差异代谢物与细菌属水平的共现性网络通过Cytoscape 3.7.1软件(https://www.cytoscape.org/)实现。用R 4.1.0软件,基于欧氏距离矩阵,通过曼特尔检验(Mantel’s test)评估土壤化学特征、微生物群落组成、代谢物组成与草莓生长、产量、品质指标之间的相关性(999次置换)。
1.5 数据处理数据统计分析使用R 4.1.0软件,采用单因素方差分析和LSD法进行方差分析(ANOVA)和多重比较(P < 0.05被认为差异显著)。用R 4.1.0和Origin 2021软件(OriginLab Corp.,USA)作图。
2 结果 2.1 禾本科绿肥介导的草莓促生、增产和提质效应与CK相比,三种绿肥处理均显著提高草莓植株干重;其中,MA处理下的草莓植株干重最大(21.5 g),增幅为53.4%(P < 0.05,图 1a)。三种绿肥处理对草莓根系形态具有改善作用,MA处理下的根表面积、根长、根平均直径和根尖数分别较CK显著增加34.4%、40.0%、21.0%和94.7%;SO处理下根表面积和根长分别较CK显著提高21.6%和23.1%;SS处理下根表面积和根长分别较CK显著增加24.9%和22.8%(图 1b-图 1e)。此外,与CK相比,MA、SO和SS处理下的根系活力分别显著提高36.0%、27.3%和30.4%;叶片叶绿素含量分别显著提高7.8%、4.1%和6.6%(图 1f-图 1g)。
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注:CK为休闲农田–草莓,MA为玉米–草莓,SO为高粱–草莓,SS为高丹草–草莓;柱状图的误差线为标准误(n = 6);不同小写字母代表处理之间的差异达到了显著水平(P < 0.05),下同。 Note: CK, fallow farmland–strawberry; MA, maize–strawberry; SO, sorghum–strawberry; SS, sorghum-sudangrass–strawberry. Error bars indicate the standard error of the mean(n = 6). Different lowercase letters above the error bars indicate significant difference among the treatments(P < 0.05). The same as below. 图 1 不同绿肥处理下的草莓生长、产量及品质参数 Fig. 1 Growth, yield, and quality parameters of strawberries treated with different green manures |
MA、SO和SS处理下的草莓果实单株产量分别较CK显著提高44.6%、16.2%和32.4%(图 1h)。对于草莓果实品质特征,与CK相比,MA和SO处理下果实总糖含量分别显著增加13.9%和8.4%;SO处理下果实总酸含量显著增加23.5%;MA、SO和SS处理下果实Vc含量分别显著增加14.4%、16.6%和15.2%;MA和SO处理下果实可溶性固形物含量分别显著增加12.8%和11.6%(图 1i-图 1l)。
2.2 禾本科绿肥改善草莓根际土壤化学特征与CK相比,MA、SO和SS处理下的土壤pH分别显著增加11.1%、4.1%和5.1%;CEC分别显著增加19.1%、14.2%和18.2%;SOM分别显著增加16.7%、15.1%和13.4%(图 2a-图 2c)。MA、SO和SS处理下的土壤AN分别较CK显著增加20.8%、13.2%和12.3%;MA处理下的土壤AP较CK显著增加23.4%;MA和SS处理下的土壤AK分别较CK显著增加18.4%和16.1%(图 2d-图 2f)。
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图 2 不同绿肥处理下的土壤化学特征 Fig. 2 Soil chemical characteristics under different green manure treatments |
此外,MA、SO和SS处理下的土壤SSC分别较CK显著增加43.9%、27.1%和12.8%;MA处理下的土壤SACP较CK显著增加18.8%;MA、SO和SS处理下的土壤SUE分别较CK显著增加210.8%、55.4%和48.3%(图 2g-图 2i)。
2.3 禾本科绿肥重塑草莓根际土壤细菌群落结构本研究总共鉴定出4 321个OTU,其中,CK、MA、SO和SS处理下根际土壤特有的OTU数分别为394、247、158和257,所有处理共有的OTU数为1 971(图 3a)。基于NMDS的第一和第二维度,不同处理下的样本能实现有效分离,表明不同绿肥处理能够改变土壤细菌群落结构(ANOSIM P = 0.001,图 3b)。与CK相比,MA和SO处理下细菌群落的Shannon和Chao1指数显著增加;SS处理下Shannon和Chao1指数增加,但不显著(图 3c-图 3d)。
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图 3 不同绿肥处理下根际土壤细菌群落特征 Fig. 3 Characteristics of rhizosphere soil bacterial communities in response to different green manure treatments |
细菌群落中优势菌属以鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)(11.9%~13.1%)、新鞘氨醇单胞菌(Novosphingobium)(5.9%~6.3%)和黄杆菌属(Flavobacterium)(0.8%~7.5%)为主(图 3e)。绿肥处理改变了细菌群落结构组成,LEfSe分析直观地展示了菌属在不同处理间存在明显的差异(图 3f)。例如:与CK相比,三种绿肥处理均显著增加了黄杆菌属、贪噬菌属(Variovorax)和鞘氨醇杆菌属(Pedobacter)的相对丰度,MA处理的效果最明显,三种菌的相对丰度分别增加7.5倍、1.8倍和5.0倍。此外,MA处理下亚栖热菌属(Meiothermus)、假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)、甲基菌属(Methylobacillus)和异根瘤菌属(Allorhizobium)被显著富集;SO处理下假黄色单胞菌属、亚栖热菌属、赭黄嗜盐囊菌属(Haliangium)和Dongia被显著富集;SS处理下鞘氨醇盒菌(Sphingopyxis)、链霉菌属(Streptomyces)和异根瘤菌属被显著富集。
2.4 禾本科绿肥重塑草莓根际土壤代谢组本研究共鉴定出96种土壤差异代谢物,包括脂类、碳水化合物、有机酸等(图 4a)。基于PCA的第一和第二维度,不同处理下的样本可以有效分离,表明不同绿肥处理能够改变土壤的代谢物组成(图 4b)。三种绿肥处理下的差异代谢物均以脂类和碳水化合物为主:脂类15~20种,其中1~2种上调(如吲哚-3-乙酸-5-甲氧基甲酯),14~18种下调(如棕榈酸、油酸、13-二十二碳烯酸和丙酸-2-羟基丙酯);碳水化合物5~12种,其中3~8种上调(如果糖、山梨糖和甘露糖),2~4种下调(如4-羟基蒽醌-2-羧酸)(图 4c)。MA处理下的差异代谢物数量最多,为57种,其中14种显著上调,43种显著下调;SO处理下的差异代谢物有35种,其中3种显著上调,32种显著下调;SS处理下的差异代谢物有38种,其中14种显著上调,24种显著下调(图 4d)。
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图 4 不同绿肥处理下根际土壤代谢组 Fig. 4 Rhizosphere soil metabolome affected by different green manure treatments |
KEGG富集分析表明,不同绿肥处理下,土壤的果糖和甘露糖代谢、不饱和脂肪酸的生物合成通路均被显著富集(P < 0.05,图 4e):果糖和甘露糖代谢通路中,三种绿肥处理均显著增加山梨糖(51.5%~89.4%)、甘露糖(52.4%~71.9%)和果糖(99.6%~129.5%)的相对丰度(图 4f);不饱和脂肪酸生物合成通路中,三种绿肥处理均显著降低棕榈酸(37.1%~71.5%)、油酸(70.1%~78.2%)和13-二十二碳烯酸(77.9%~85.2%)的相对丰度,MA处理下硬脂酸的相对丰度也显著降低44.2%(图 4g)。糖类和脂类代谢物的改变均以玉米绿肥的效果最为明显。共现性网络分析表明,土壤代谢物与微生物属形成了复杂的互作网络(图 5a)。其中,果糖(TMWN0424)、山梨糖(TMWN0643)、甘露糖(TMWN0547)均与黄杆菌属、鞘氨醇杆菌属和贪噬菌属呈显著正相关;棕榈酸(TMWN0580)、油酸(TMWN0325)、13-二十二碳烯酸(TMWN0639)、硬脂酸(TMWN0228)均与这三种菌属呈显著负相关。
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注:黄色或蓝色线条分别代表代谢物/细菌属之间呈显著正或负相关(P < 0.01),蓝色或紫色圆圈分别代表细菌属或代谢物。 Note: Yellow or blue lines represent significant positive or negative correlations between metabolites/bacterial genera(P < 0.01), respectively; blue or purple circles represent bacterial genera or metabolites, respectively. 图 5 草莓根际土壤差异代谢物与细菌属的共现性网络(a)和土壤化学特征、微生物群落组成、代谢物组成与草莓生长、产量、品质指标的曼特尔检验(b) Fig. 5 Cooccurrence network of differentially accumulated metabolites and bacterial genera in the rhizosphere soil of strawberry(a) and Mantel's tests between soil chemical characteristics, microbial community composition, metabolite composition/strawberry growth, yield, fruit quality indices(b) |
曼特尔检验的结果表明,土壤化学特征、微生物群落组成、代谢物组成与草莓生长、产量、品质指标之间均呈显著正相关关系(P < 0.05,图 5b)。
3 讨论本研究发现,禾本科绿肥处理介导后茬草莓的促生、增产和提质效应。禾本科绿肥处理下,草莓植株的干重增加,根系形态改善、活力提高,叶片叶绿素含量增加,果实产量提高、品质改善。这与以往的研究[22-24]发现豆科绿肥翻压对后茬作物(如小麦、玉米)的生长和产量效应一致。三种绿肥处理的作用效果存在差异,其中玉米绿肥的效果最为明显。基于土壤代谢组和微生物组学分析,揭示了以玉米为主的禾本科绿肥介导草莓产量形成和品质改善的机制。
土壤代谢物是植物-微生物互作的重要介质。然而,目前尚无研究报道绿肥介导下的土壤代谢物-微生物协同变化模式,及该模式对植物的作用效应,本研究则弥补了这一空白。本研究中,禾本科绿肥处理主要上调了土壤特定糖类代谢物(果糖、山梨糖和甘露糖)的相对丰度,但下调了脂类代谢物(如棕榈酸、硬脂酸、油酸)的相对丰度,其中玉米绿肥的效果最为明显。前人研究表明,果糖、山梨糖和甘露糖不仅能作为碳源被根际微生物利用,还可以诱导植物根际促生菌等有益细菌的趋化作用及生物膜形成,进而对植物起到促生、抗病等效应[13-14]。
多数研究表明,绿肥处理增加大田土壤细菌群落的多样性和丰度。例如,豆科绿肥增加湘西烟田土壤细菌群落多样性[25]和湖南水稻土细菌群落丰度与多样性[26]。本研究同样观察到禾本科绿肥处理提高草莓根际细菌群落的多样性(基于Shannon及Chao1指数的增加)。此外,绿肥的施用重塑了细菌群落结构的组成。例如,三种绿肥处理均增加了黄杆菌属、贪噬菌属和鞘氨醇杆菌属的相对丰度,且以玉米绿肥的增幅最大。研究表明,黄杆菌通过活化土壤中的氮素促进植物对氮的吸收,产生植物生长激素促进小麦生长,通过拮抗病原菌(立枯丝核菌)提高小麦的立枯病抗性[27-28]。鞘氨醇杆菌增强油菜的重金属耐受性,同时改善油菜的根系形态[29]。贪噬菌可以通过产生铁载体和1-氨基环丙烷-1-羧酸脱氨酶的方式促进白菜和青椒生长[30]。共现性网络分析的结果表明,果糖、山梨糖和甘露糖均与有益根际微生物(如黄杆菌、鞘氨醇杆菌和贪噬菌)呈显著正相关。这说明绿肥处理可能通过上调土壤中特定糖类代谢物的相对丰度,进而招募根际有益细菌。此外,相较于高粱和高丹草绿肥,玉米绿肥处理下的土壤糖类代谢物(果糖、山梨糖和甘露糖)相对丰度增幅最高,因而能够招募更多的有益微生物。
脂类代谢物(如棕榈酸、硬脂酸、油酸)作为土壤中存在的主要化感物质已被报道会抑制作物生长及产量形成[5-6]。然而,芽孢杆菌和根瘤菌等多种微生物可以降解或利用化感物质[16]。本研究中,绿肥处理降低了连作草莓根际土壤中脂类化感物质棕榈酸、硬脂酸和油酸的相对丰度。共现性网络分析表明,这些脂类代谢物与有益菌(黄杆菌、鞘氨醇杆菌和贪噬菌)呈显著负相关。可以推测,禾本科绿肥通过富集有益微生物来降解草莓连作土壤中的脂类化感物质。与高粱和高丹草绿肥相比,玉米绿肥富集的有益微生物最多,因而脂类化感物质的含量最少。这与刘贤文和郭华春[31]发现玉米-马铃薯间作富集黄杆菌,同时降解脂类化感物质的研究结果相一致。迄今尚未见研究报道鞘氨醇杆菌和贪噬菌能够缓解作物化感作用,但根据本研究结果推测这两株菌具有降解脂类化感物质的潜在作用。曼特尔检验的结果表明,土壤微生物群落组成、代谢物组成均与草莓生长、产量、品质指标之间呈显著正相关关系。基于此,本研究揭示了一种绿肥介导下的土壤代谢物-微生物协同变化模式:绿肥引起土壤特定糖类代谢物积累,进而招募有益微生物降解脂类化感物质,这一模式对草莓生长和产量形成了正效应。
此外,本研究中,禾本科绿肥处理提高了设施大棚土壤SOM、CEC、AN、AP和AK含量,且以玉米绿肥效果最佳。前人研究发现,种植并翻压豆科绿肥通过提高土壤SOM含量、离子交换吸附能力,以及氮、磷和钾素供应,从而提高土壤肥力,保证后茬作物的产量与品质[32-33]。由此可见,禾本科绿肥在改善土壤化学特征方面与豆科绿肥具有相似的效果。土壤酶活性是土壤质量和肥力的重要指标,与土壤养分循环密切相关[34]。例如,SSC、SACP和SUE分别参与土壤中碳、磷和氮素的转化[35]。本研究表明,不同禾本科绿肥处理对土壤酶活性的影响有所差异。其中,玉米绿肥翻压对土壤酶活性提升的效果最为明显,从而最大幅度地提高了土壤肥力。有益微生物黄杆菌、鞘氨醇杆菌和贪噬菌也具有活化土壤氮磷钾养分的作用[27,36],玉米绿肥介导土壤代谢物-微生物协同变化模式富集的更多有益微生物提高了土壤养分的有效性。此外,禾本科绿肥翻压提高了酸性土壤的pH。酸性土壤的改良也有利于提高土壤养分的有效性并对作物生长和产量形成正效应[37]。
4 结论长期禾本科绿肥翻压能促进设施大棚草莓植株生长,提高果实产量,并改善果实品质。此外,绿肥处理改善了土壤化学特性,通过重塑根际土壤代谢组来富集有益细菌、缓解草莓化感自毒作用。玉米、高粱和高丹草三种禾本科绿肥中,玉米绿肥对后茬草莓的作用效果最为明显。因此,种植和翻压以玉米为主的禾本科绿肥轮作措施是设施大棚草莓增产和提质的有效措施。
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