《土壤学报》的前身是《中国土壤学会会志》(Bulletin of the Soil Science Society of China),于1948年12月创刊。1952年更名为《土壤学报》。1955―1956年定期出版,为半年刊,科学出版社出版。1957年起由半年刊改为季刊,全国各地邮局发行。1966年下半年由于科研工作停顿停刊。1978年8月经中国科学院批准正式复刊。该刊历任主编:1948年主编宋达泉,1950―1954年主编马溶之,1955―1983年主编熊毅,1984―1996年主编鲁如坤,1996―2003年主编季国亮,2004―2012年主编蔡祖聪,2012―2020年主编史学正,2020年起主编徐仁扣。